Readspeaker Menü

Christian Knüpfer

Diplom-Informatiker

deutsch


 Büro:

Zi. 3237
Ernst-Abbe-Platz 2

Telefon:
+49 3641 9-46353

Fax:

+49 3641 9-46302

E-Mail:

PGP: Key-ID=0x3DF5F43F, Public Key
  Fingerprint 1100 7077 B84A 7538 99F7  CE95 A24E F944 3DF5 F43F

Anschrift:

Friedrich-Schiller-Universität Jena
Fakultät für Mathematik und Informatik
Institut für Informatik
Arbeitsgruppe Künstliche Intelligenz

Ernst-Abbe-Platz 2
D-07743 Jena
Germany

Teaching

see Courses (in German).

Projects


 sembiotics-logo_small Sembiotics:
Formal Semantics of Bio-Models




teddy-logo TEDDY:
TErminology for the Description of DYnamics of Bio-Models




teddy-logo.png Artificial Gene Expression:
Generating Test Data for the Validation of Reverse Bioengineering(Diploma Thesis 2002-2003)

 

planned Projects:

Publications

  • Mélanie Courtot; Nick Juty; Christian Knüpfer; Dagmar Waltemath; Anna Zhukova; Andreas Dräger; Michel Dumontier; Andrew Finney; Martin Golebiewski; Janna Hastings; Stefan Hoops; Sarah Keating; Douglas B Kell; Samuel Kerrien; James Lawson; Allyson Lister; James Lu; Rainer Machne; Pedro Mendes; Matthew Pocock; Nicolas Rodriguez; Alice Villeger; Darren J Wilkinson; Sarala Wimalaratne; Camille Laibe; Michael Hucka und Nicolas Le Novère (2011):
    Controlled vocabularies and semantics in systems biology.
    In: Molecular Systems Biology 7:543. doi:10.1038/msb.2011.77.
  • Christian Knüpfer, Clemens Beckstein, Peter Dittrich (2007):
    How to Formalise the Meaning of a Bio-Model: A Case Study.
    In: BMC Systems Biology 1 (Suppl 1), BioSysBio 2007: Systems Biology, Bioinformatics, Synthetic Biology - Meeting abstracts. Manchester, UK. 11-13 January 2007, p.28. preprint (pdf), BibTeX.
  • Christian Knüpfer, Clemens Beckstein, Peter Dittrich (2006):
    Towards a Semantic Description of Bio-Models: Meaning Facets -- A Case Study
    In: Ananiadou, S., Fluck, J. (Eds.): Proceedings of the Second International Symposium on Semantic Mining in Biomedicine (SMBM 2006), Jena, April 9-12, 2006. CEUR-WS, Aachen, RWTH University, pp.97-100.
    online at CEUR-WS, print version (pdf), BibTeX.
  • Christian Knüpfer, Peter Dittrich, Clemens Beckstein (2004):
    Artificial Gene Regulation: A Data Source for Validation of Reverse Bioengineering
    In: H. Schaub, F. Detje, U. Brüggemann (Eds.), Proceedings of the 6th German Workshop on Artificial Life (GWAL6), April 14-16, 2004, Bamberg, Germany, pp. 66-75, Akademische Verlagsgesellschaft Aka, Berlin.
    preprint (pdf), BibTeX
  • Christian Knüpfer (2003):
    Testdatengenerierung für die Inferenz von Genregulationsnetzen
    Diplomarbeit, Friedrich-Schiller-Universität Jena.
    PDF-File, BibTeX
  • Christian Knüpfer (1993):
    Vergleichende Untersuchung zur Abtrennung von Biomasse aus mikrobiellen Kulturlösungen unter Verwendung verschiedener Gerätesysteme
    Diplomarbeit (FH), Fachhochschule Merseburg.
    BibTeX
  • Christian Knüpfer (1992):
    Erarbeitung und Anwendung eines Programms zur rechnergestützten Meßwerterfassung von Potentialabfallkurven an wasserstoffentwickelnden Elektroden
    Ingenieurarbeit, Staatliche Technikerschule Berlin.
    BibTeX