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Christian Knüpfer

Diplom-Informatiker

deutsch

		Büro:		Zi. 3237 Ernst-Abbe-Platz 2
		Telefon:		+49 3641 9-46353
		Fax:		+49 3641 9-46302
		E-Mail:		PGP: Key-ID=0xC3329342, Public Key
		Anschrift:		Friedrich-Schiller-Universität Jena Fakultät für Mathematik und Informatik Institut für Informatik Arbeitsgruppe Künstliche Intelligenz Ernst-Abbe-Platz 2 D-07743 Jena Germany

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Teaching

see Courses (in German).

Projects

		Sembiotics: Formal Semantics of Bio-Models
		TEDDY: TErminology for the Description of DYnamics of Bio-Models
		Artificial Gene Expression: Generating Test Data for the Validation of Reverse Bioengineering(Diploma Thesis 2002-2003)

 

planned Projects:

• Evolution of Semantic Systems

Publications

• Christian Knüpfer, Clemens Beckstein, Peter Dittrich (2007):
  How to Formalise the Meaning of a Bio-Model: A Case Study.
  In: BMC Systems Biology 1 (Suppl 1), BioSysBio 2007: Systems Biology, Bioinformatics, Synthetic Biology - Meeting abstracts. Manchester, UK. 11-13 January 2007, p.28. preprint (pdf), BibTeX.
• Christian Knüpfer, Clemens Beckstein, Peter Dittrich (2006):
  Towards a Semantic Description of Bio-Models: Meaning Facets -- A Case Study
  In: Ananiadou, S., Fluck, J. (Eds.): Proceedings of the Second International Symposium on Semantic Mining in Biomedicine (SMBM 2006), Jena, April 9-12, 2006. CEUR-WS, Aachen, RWTH University, pp.97-100.
  online at CEUR-WS, print version (pdf), BibTeX.
• Christian Knüpfer, Peter Dittrich, Clemens Beckstein (2004):
  Artificial Gene Regulation: A Data Source for Validation of Reverse Bioengineering
  In: H. Schaub, F. Detje, U. Brüggemann (Eds.), Proceedings of the 6th German Workshop on Artificial Life (GWAL6), April 14-16, 2004, Bamberg, Germany, pp. 66-75, Akademische Verlagsgesellschaft Aka, Berlin.
  preprint (pdf), BibTeX
• Christian Knüpfer (2003):
  Testdatengenerierung für die Inferenz von Genregulationsnetzen
  Diplomarbeit, Friedrich-Schiller-Universität Jena.
  PDF-File, BibTeX
• Christian Knüpfer (1993):
  Vergleichende Untersuchung zur Abtrennung von Biomasse aus mikrobiellen Kulturlösungen unter Verwendung verschiedener Gerätesysteme
  Diplomarbeit (FH), Fachhochschule Merseburg.
  BibTeX
• Christian Knüpfer (1992):
  Erarbeitung und Anwendung eines Programms zur rechnergestützten Meßwerterfassung von Potentialabfallkurven an wasserstoffentwickelnden Elektroden
  Ingenieurarbeit, Staatliche Technikerschule Berlin.
  BibTeX